Quatrième année d'internat de médecine générale : les modalités de paiement des MSU révisées

Article mis à jour le 05/10/2026 : correction sur les primes versées par l'Assurance maladie

Alors que la procédure d'appariement des futurs docteurs juniors s'est ouverte ce mardi 1er septembre, le Collège national des généralistes enseignants (CNGE) "tient à saluer et féliciter l'ensemble des acteurs mobilisés" autour de la réforme de la quatrième année de médecine générale. L'instance cite notamment, dans un communiqué, les départements universitaires de médecine générale, les collèges régionaux, les facultés, les ARS et les maîtres de stage universitaires (MSU).  

En effet, selon le Pr Olivier Saint-Lary, la quasi-totalité des subdivisions ont un nombre suffisant de terrains de stage ambulatoires. Un objectif qui "n'était pas gagné" d'avance, a reconnu le généraliste, dans un précédent article pour Egora.    

Des paiements effectués par l'Assurance maladie 

Surtout, à deux mois du début de cette quatrième année, le CNGE annonce une nouvelle avancée concernant le paiement des MSU. Initialement, la réforme prévoyait un versement des indemnités par les universités. "On avait des craintes vis-à-vis de ces modalités de rémunération, avec certains MSU qui n'auraient pas du tout été payés dans les temps", parfois avec six mois voire plus d'un an de retard, explique le Pr Saint-Lary. "Je pense que beaucoup d'entre eux n'auraient pas renouvelé [après cette première quatrième année]." 

Ces modalités ont finalement été révisées. Finalement, c'est l'Assurance maladie qui va prendre en charge le versement des primes en cas d'exercice en ZIP, ZAC ou QPV, de supervision de la PDSA et la compensation forfaitaire en cas de part importante de la patientèle bénéficiant d'une exonération de participation. "Cela va vraiment sécuriser les délais de paiement […] L'Assurance maladie a une capacité de réactivité bien meilleure et de paiement plus efficace", indique le président du CNGE, qui espère que la rémunération des MSU sera à terme "mensualisée".  

La prime pédagogique de 600 euros brut reste, quant à elle, versée par les universités, précise à Egora le Dr Raphaël Dachicourt, délégué national de MG France. Enfin, les montants des tickets modérateurs liés à l'activité du docteur junior seront directement reversés au MSU de rattachement. 

Pour l'heure, la procédure d'affectation des futurs docteurs juniors vient de débuter. "Le CNGE reste pleinement vigilant et mobilisé afin de contribuer au bon déroulement de l’appariement", peut-on lire dans le communiqué.