Covid : que sait-on du nouveau sous-variant JN-1 ?

18/12/2023 Par Marielle Ammouche
Infectiologie
Le Covid est actuellement en pleine expansion. Les sujets de plus de 65 ans sont particulièrement nombreux parmi les hospitalisations dues à ce virus.  

 

Le variant BA.2.86 est devenu majoritaire en France hexagonale, représentant 46% des séquences dans la dernière enquête Flashs (20 novembre), devant EG.5 qui représentait encore 30% des séquences.  

"On a une tendance à une dynamique de remplacement, confirmait Santé publique France (SPF) en conférence de presse le 13 décembre. Mais cette dynamique est classique par rapport à ce qu’on a vu depuis Omicron, pas spécialement rapide, et pas comparable, avec ce qui a été observé lors du remplacement de Delta par Omicron. Donc on n’est pas dans une situation particulièrement inquiétante." 

Les variants XBB.1.5, XBB.1.16, XBB.1.9 et XBB.2.3 continuent à circuler, mais à "des niveaux faibles" : 9% (pour XBB.1.5) et 3% (pour XBB.1.16, XBB.1.9 et XBB.2.3). 

Au sein de BA.2.86, l’épidémie actuelle est portée principalement par le sous-lignage JN.1. Ce dernier représentait 39% des séquences, au 20 novembre, en nette hausse par rapport à l’analyse précédente. Santé publique France précise dans sa dernière analyse de risques des variants émergents (au 11 décembre) qu'"aucun signal préoccupant" n’a été identifié, que ce soit pour BA.2.86 ou pour JN.1. 

D'après les premières données in vitro, JN.1 semble présenter un échappement immunitaire supérieur à BA.2.86, "mais qui pourrait être partiellement compensé par une diminution de transmissibilité", même si ces résultats doivent être confirmés en vie réelle.  

Toutes les régions françaises métropolitaines présentent globalement la même situation virologique. Dans les Drom, c’est XBB qui domine, mais le variant BA.2.86 commence à y être détecté, notamment à La Réunion, en Guyane et à Mayotte. 

La situation française est un peu différente de celle du monde car, à l’échelle internationale, c’est encore le variant EG.5 qui est majoritaire, malgré une légère diminution avec 48% des séquences entre le 12 novembre et le 11 décembre. 

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MICHAEL FINAUD
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Débatteur Passionné
Médecins (CNOM)
il y a 2 ans
On ne sait pas comment Egora trouve les données sur les hospitalisations Covid-19 chez les sujets âgés, car s'il existe effectivement des cas de portage de SARS-CoV-2 variant Omicron dans les Ehpads, comme il faudra certainement s'y préparer tous les 3 mois, je n'arrive pas à trouver un nombre d'hospitalisations conséquent, au contraire, étant gériatre dans une grande ville , j'observe qu'il y a bien des raisons d'être hospitalisé chez les PA , la grippe, le VRS, les mycoplasmes, les bronchiolites, les fausses routes, les pyélonéphrites, les fractures du fémur, en grande partie par la pénurie de médecins et soignants dans les Ehpads, mais Omicron non, on ne voit pratiquement plus de cas sévères depuis fin 2022 dans cette population. Merci de me donner des sources fiables si elles existent.
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PIERRE HANRION
64 points
Médecine générale
il y a 2 ans
Est-il possible de connaître enfin le taux de protection de la vaccination actuelle contre ce variant ? L'assouplissant silence des autorités de santé m'incite à penser que ce taux esr très faible. Travaillant en Ehpad je confirme n'avoir hospitalisé aucun cas de Covid malgré deux petites épidemies.
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Francois Lhuisset
1,7 k points
Débatteur Passionné
il y a 2 ans
Quel intérêt à énumérer tous ces variants? Cela n'a plus aucun intérêt clinique, c'est fait pour affoler les mougeons et les pense-menus, et bien sûr promouvoir des injections magiques de thérapie génique à efficacité négative.
 
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